Locus class | MDSC-P | MDSC-D1 | MDSC-D3 | |||
---|---|---|---|---|---|---|
Unique sRNAs | Total sRNAs | Unique sRNAs | Total sRNAs | Unique sRNAs | Total sRNAs | |
Total | 106806 (100 %) | 5871055 (100 %) | 68492 (100 %) | 5922188 (100 %) | 66603 (100 %) | 5935963 (100 %) |
miRNA | 3056 (2.86 %) | 4844028 (82.51 %) | 2328 (3.40 %) | 4850321 (81.90 %) | 2483 (3.73 %) | 5051419 (85.10 %) |
exon_antisense | 473 (0.44 %) | 1428 (0.02 %) | 164 (0.24 %) | 410 (0.01 %) | 141 (0.21 %) | 467 (0.01 %) |
exon_sense | 5111 (4.79 %) | 7313 (0.12 %) | 3167 (4.62 %) | 4056 (0.07 %) | 2892 (4.34 %) | 3564 (0.06 %) |
intron_antisense | 2759 (2.58 %) | 4632 (0.08 %) | 899 (1.31 %) | 1355 (0.02 %) | 874 (1.31 %) | 1201 (0.02 %) |
intron_sense | 4057 (3.80 %) | 7573 (0.13 %) | 1823 (2.66 %) | 2844 (0.05 %) | 1337 (2.01 %) | 2175 (0.04 %) |
rRNA | 9082 (8.50 %) | 64109 (1.09 %) | 9408 (13.74 %) | 79061 (1.33 %) | 9454 (14.19 %) | 108407 (1.83 %) |
repeat | 7322 (6.86 %) | 15735 (0.27 %) | 2490 (3.64 %) | 4508 (0.08 %) | 2208 (3.32 %) | 4167 (0.07 %) |
scRNA | 104 (0.10 %) | 1025 (0.02 %) | 120 (0.18 %) | 2064 (0.03 %) | 134 (0.20 %) | 2295 (0.04 %) |
snRNA | 591 (0.55 %) | 2554 (0.04 %) | 461 (0.67 %) | 2024 (0.03 %) | 332 (0.50 %) | 1454 (0.02 %) |
snoRNA | 583 (0.55 %) | 1666 (0.03 %) | 568 (0.83 %) | 1496 (0.03 %) | 487 (0.73 %) | 1374 (0.02 %) |
srpRNA | 66 (0.06 %) | 134 (0.00 %) | 100 (0.15 %) | 175 (0.00 %) | 85 (0.13 %) | 312 (0.01 %) |
tRNA | 5712 (5.35 %) | 48058 (0.82 %) | 3893 (5.68 %) | 29959 (0.51 %) | 4428 (6.65 %) | 35856 (0.60 %) |
unann | 67890 (63.56 %) | 872800 (14.87 %) | 43071 (62.88 %) | 943915 (15.94 %) | 41748 (62.68 %) | 723272 (12.18 %) |